Думаю, вредный флуд бывает. в редких случаях (спецтемы и т.п)
В Флейме же люди, как правило хотят просто общаться, и флуд в таких случаях неизбежен, но, считаю, что он безвредный и даже, бывает, читается интересней, чем сама тема и вряд ли повредит теме, если тема по настоящему сильная, вотребована и не раскрыта.
Еще есть такой момент, что автор темы предполагал, что тема пойдет другим путем и временные отклонения от темы могут тормозить ее или перерасти в тему совсем не такую, как задумывал автор.
Что тут можно сделать? Не создавать же отдельный раздел для "авторских серьезных" тем, хотя, а почему бы и нет?
Еще могу посоветовать авторам, которые видят вредоность флуда в своей теме, говорить об этом, призвать вернуться к теме. если тема на тот момент себя не исчерпала - флуд ей не помешает